Международный консорциум анонсировал проект по сбору высококачественных последовательностей генома 66 тысяч видов позвоночных по всей Земле, включая млекопитающих, птиц, рептилий, амфибий и рыбу.
Сколько земных видов можно спасти
Консорциум под названием G10K первоначально планировал секвенировать геномы не менее 10 тысяч видов позвоночных животных, но теперь, благодаря огромным успехам и снижению стоимости технологий, G10K решила поднять ставки и секвенировать как самцов, так и самок каждого из приблизительно 66 тыс. видов на Земле.
Создатели проекта объявили о новых целях во время конференции, которая проводилась в Университете Рокфеллера в Нью-Йорке. Проект будет включать более 150 экспертов из 50 институтов и 12 стран. Вместе с объявлением они представили 14 новых высококачественных видов, включая геномы большой подковообразной летучей мыши, канадской рыси, утконоса, колибри Анны, попугая какапо (которых осталось всего 150), черепахи пустыни Гуд, хвостатой червяги (странной амфибии, похожей на змею) и анабаса. Эти 14 геномов и другие, собранные в рамках проекта, будут доступны ученым для целей исследования.
Не просто секвенирование
Как и проект генома человека, это предприятие определенно осуществит прорывы в высококачественной сборке генома, что приведет к уменьшению ошибок. Проект также займется важными вопросами в биологии и медицине, что сразу же станет полезно для изучения эволюции и консервационной биологии. Полный каталог позвоночных видов Земли мог бы послужить защитой — как для предотвращения вымирания, так и для возможного восстановления видов в будущем.
Оливер Райер, соучредитель G10K и директор Института консервационных исследований при зоопарке Сан-Диего, говорит, что у VGP есть потенциал «трансформировать все сферы биологии». Он считает, что ученые смогут понять причины вымирания, а также появление вредных мутаций, инбридинга и генетических узких мест. Люди получат возможность сохранить свое биологическое наследие.
Не останавливаясь на достигнутом
Для создания высококачественных сборок генома, команда VGP отдает предпочтение «длинным записям», нежели коротким, то есть, когда технологии секвенирования производят длинные фрагменты генетических данных. Из них проще было бы собирать ДНК-последовательности в целые хромосомы.
Кроме того, ученые будут воздерживаться от объединения мужских и женских хромосом в один геном, что приводит к слишком большим ошибкам. Вместо этого команда будет собирать как отцовскую, так и материнскую ДНК отдельных особей. Каждый вид будет собираться по отдельности и так, чтобы работу не нужно было повторять в будущем.
Не так давно это требовало многих лет для завершения генома даже одного животного. Современные технологии в скором времени позволят создавать целый геном за одну неделю.
Новые последовательности геномов будут храниться в базе данных Genome Ark («Ковчег»), цифровой открытой библиотеке геномов. Хорошее дело делают?
Источник — http://hi-news.ru